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生物信息入门,python or perl?

发布于:17-03-01  |   作者:邓飞龙

再次有朋友加我QQ问我生物信息如何入门,应该学习python还是perl。实话说,虽然已经学习生物信息三年有余,但是限于自己所处的环境以及自己的天赋,我一直认为自己并没有太大的进步。而在编程方面更是半路出家的和尚,称不上一个合格的码农,也称不上是一个p

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标签:python 日志分类:杂七杂八围观群众:249人
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关于博主

发布于:16-11-21  |   作者:admin

【本着绝不吹牛,吹牛也不打草稿的原则,做简单的自我介绍】 我爸给我起名 邓飞龙 ,沿用至今,打算长期使用并刻于墓碑,属于第一批出生的90后。本科就读于雅安最强高校 四川农业大学 ,并有幸继续随迁校大军移至 成都温江 继续我的读书生涯,目前是硕士研究

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标签: 日志分类:杂七杂八围观群众:330人
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python编程中的if __name__ == 'main': 的作用和原理

发布于:16-11-17  |   作者:admin

在大多数编排得好一点的脚本或者程序里面都有这段if __name__ == main: ,虽然一直知道他的作用,但是一直比较模糊,收集资料详细理解之后与打架分享。 1、这段代码的功能 一个python的文件有两种使用的方法,第一是直接作为脚本执行,第二是import到其他的p

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标签:python 日志分类:杂七杂八围观群众:4959人
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circos命令行常用指令和参数

发布于:16-11-16  |   作者:admin

所谓常用还是有点勉强,作图基本上很少用到这些命令,只需要在配置文件里面写入即可。只是有时候需要对circos的参数做临时性的改动,避免对配置文件频繁改动,才会使用这些命令。

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标签:circos 日志分类:杂七杂八围观群众:1088人
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从基因组可视化工具——circos说起,circos安装

发布于:16-11-16  |   作者:admin

这是博客改版的第一篇博文,选择最近使用的生物信息学软件circos开始写起。circos是用perl写的生物软件,从发表的文章来看 学习circos主要是熟悉配置文件的编辑方法,搞清楚其中的标签、参数的含义。只有完全清楚了这些东西才能够轻松自如的让circos绘制出

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标签:circos 日志分类:杂七杂八围观群众:4311人
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python程序打包成可执行文件

发布于:16-01-13  |   作者:admin

目前我也正在一边学习python一边写一个小软件,看到 鸣一道 兄的博客中这篇文章,感觉很快就会用得着,故转载之。 优点: 1. pyinstaller 是跨平台的可以用在linux和windows系统上 2. 操作非常简单,几个命令就搞定了,这个比py2exe容易用多了 缺点: 1. 打

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标签:python 日志分类:杂七杂八围观群众:305人
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Soap2/ SOAPaligner短序列比对软件用法

发布于:15-10-13  |   作者:admin

Soap2/ SOAPaligner 短序列比对软件,没有提供源代码,所以只能下载对应版本,如果没有就联系官方。

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标签:生物信息学软件 日志分类:杂七杂八围观群众:1331人
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circos绘图highlight.conf设置-绘制多层染色体圈图

发布于:15-09-24  |   作者:admin

在基因组绘图中,多层圈图是不得不提的重要内容。大多数情况下不可能只绘制一个基因组,还需要绘制其他 圈层来表达数据的内容。因此就可以使用highlight来表达。 highlight设置(重要的部分,主要用于多层全图的绘制) 1、highlights #highlight的最顶层标签

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标签:circos 日志分类:杂七杂八围观群众:2662人
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